Flumequine có liên quan đến độc tính mắt nghiêm trọng, loại trừ sử dụng ở bệnh nhân người.[14][15][16] toán do thuốc (sỏi thận) cũng có liên quan đến liệu pháp này.[41][42][43] Sốc phản vệ gây ra bởi liệu pháp flumequine cũng có liên quan đến việc sử dụng thuốc.[18][19][44] Phản ứng phản vệ như sốc, nổi mề đay và phù Quincke đã được báo cáo thường xuất hiện trong vòng hai giờ sau khi uống viên thuốc đầu tiên. Có 18 báo cáo được liệt kê trong hồ sơ của WHO vào năm 1996.[45] Như với tất cả các loại thuốc trong nhóm này, liệu pháp flumequine có thể dẫn đến các phản ứng nghiêm trọng của hệ thần kinh trung ương (CNS),[46][47][48] nhiễm độc quang dẫn đến da phản ứng như ban đỏ, ngứa, nổi mề đay và phát ban nghiêm trọng,[49][50] rối loạn tiêu hóa và thần kinh.[8]